La Vallée du Vent est un petit royaume agricole, protégé des spores et de la fukai par des vents marins. Sa tranquillité se trouve perturbée par le naufrage d’un immense vaisseau de l’empire tolmèque pris pour cible par des insectes depuis une halte malheureuse dans la forêt toxique. Afin de récupérer la cargaison de ce vaisseau, les troupes tolmèques envahissent la vallée ; elles assassinent le vieux roi Jill par fusillade et font prisonnière sa fille Nausicaä.
Il s’avère que cette cargaison, si précieuse aux yeux des Tolmèques, est un guerrier géant descendant des colosses ayant anéanti le monde lors des « sept jours de feu ». Les Tolmèques veulent l’utiliser pour brûler la forêt toxique et cela au détriment des peuples voisins à qui ils font la guerre. Cet incendie risquerait de provoquer le courroux de milliers d’ômus et leur raz-de-marée serait dévastateur comme cela l’avait été dans le passé lorsqu’ils avaient provoqué l’anéantissement de nations entières.
Nausicaä, parvenant à s’échapper, découvre que la fukai n’empoisonne pas l’environnement, mais qu’elle le purifie en drainant l’air et les sols pollués. Guidée par son amour de tous les êtres vivants et accompagnée de son familier Teto, elle va tenter par tous les moyens de faire taire la guerre, sauver l’humanité et rétablir un équilibre entre les êtres humains et la nature.
Musique : Joe Hisaishi